Центар за конзервацију-рестаурацију се бави конзервацијом и рестаурацијом свих врста културних добара материјалне и нематеријалне баштине, развијањем и реализацијом програма, пројеката и студија из области конзервације-рестаурације културних добара и развијањем и реализацијом  едукативних програма у тој области. Поред тога, Центар пружа стручну помоћ у области конзервације културних добара.

У оквиру центра за конзервацију-рестаурацију тренутно фукционишу: Одељење за музејске предмете и грађу (Атеље за конзервацију керамике, стакла и витража, Атеље за конзервацију мозаика и камена, Атеље за конзервацију метала; Атеље за конзервацију слика на платну, папиру и дрвету; Атеље за конзервацију текстила; Атеље за конзервацију органског материјала), Одељење за очување нематеријалне баштине и Одељење за археолошке локалитете. Током 2011. године почеће са радом и Одељење за непокретна културна добра. У каснијим фазама развоја Института планирано је оснивање Одељења за архивску и библиотечку грађу и Одељења за аудиовизуелну и дигиталну грађу и др.