Oдељeње за археолошке локалитете бави се реализацијом и развијањем пројеката и едукативних програма из области конзервације археолошког наслеђа. Конзервација археолошког наслеђа поставља комплексне проблеме и подразумева сарадњу не само конзерватора различитих специјалности већ и стручњака из домена природних и друштвених наука.

Из тог разлога Одељење за археолошке локалитете тесно сарађује са осталим центрима и одељењима ЦИК-а, као и са разним националним и међународним институцијама заштите културне баштине.

Одељење је укључено у истраживање Конзервација мозаика и обука конзерватора у Југоисточној Европи (Mosaic Conservation and Training of Conservators in Southeast Europe)